代理营业机构发生涉案金额等值的情况，首先需要明确的是，这通常涉及到经济犯罪或经济纠纷，应当依法由公安机关进行立案侦查，并根据调查结果作出相应处理。以下是对此问题的详细分析：

一. 涉案金额等值的处理原则

1. 立案侦查：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十五条，公安机关对已经立案的刑事案件，应当进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。这意味着，当代理营业机构发生涉案金额等值的情况时，首先应由公安机关介入，进行详细的侦查工作。

2. 依法处理：在侦查过程中，公安机关会根据收集到的证据，对涉案人员依法进行处理。这可能包括拘留、逮捕等强制措施，以及后续的起诉、审判等程序。

二. 代理营业机构应采取的措施

1. 配合调查：代理营业机构在发生涉案金额等值的情况时，应积极配合公安机关的调查工作，提供必要的证据和资料，以便公安机关能够迅速、准确地查明事实。

2. 内部自查：同时，代理营业机构也应进行内部自查，查找问题根源，加强内部管理，防止类似问题再次发生。

三. 法律建议

1. 及时报案：一旦发现涉案金额等值的情况，代理营业机构应立即向公安机关报案，以便及时启动侦查程序。

2. 咨询专业意见：在处理过程中，代理营业机构可以寻求专业律师的法律意见，以确保自身权益得到妥善保护。

综上所述，代理营业机构发生涉案金额等值的情况时，应依法由公安机关进行立案侦查，并根据调查结果作出相应处理。代理营业机构应积极配合调查，加强内部管理，并寻求专业法律意见以保护自身权益。 如有进一步需要，您可以继续咨询我。