在办理职务犯罪案件中，确实会遇到诸多疑难问题，这些问题主要涉及犯罪主体的认定、犯罪行为的界定、证据的收集与审查以及法律适用等方面。以下是对这些疑难问题的详细分析：

一. 犯罪主体认定的疑难问题

1. 身份界定的复杂性：职务犯罪的主体通常具有特定的身份，如国家机关工作人员、公司企业人员等。但在实践中，对于某些特殊身份人员的认定存在困难，如临时雇佣人员、劳务外包人员等是否属于单位人员，需结合其实际工作职责、管理关系及合同性质综合判断。
2. 单位性质的认定：对于民办非企业单位、农村集体经济组织等特殊单位的性质认定，也是办理职务犯罪案件中的一个难点。需要仔细考察其组织结构、运营方式及资产归属，以确定是否符合“单位”范畴。

二. 犯罪行为界定的疑难问题

1. “利用职务便利”的判定：职务犯罪往往涉及行为人利用职务上的便利进行非法活动。但如何准确判定行为人是否利用了职务便利，是一个复杂的问题。需要综合考虑行为人的职责、权限以及其行为与职务之间的关联性。
2. 侵占行为与业务往来的区分：在职务犯罪中，行为人往往会利用业务往来进行非法侵占。因此，如何准确区分正常的业务往来与侵占行为，是办理此类案件的一个关键。这要求办案人员仔细甄别行为人的交易行为是否真实、合理，并结合公司财务记录、内部约定等证据进行综合判断。

三. 证据收集与审查的疑难问题

1. 证据关联性判断：在职务犯罪案件中，证据的关联性对于定罪量刑至关重要。办案人员需要从证据的客观性、合法性和关联性出发，准确筛选出能够证明行为人实施职务犯罪行为的关键证据。
2. 电子证据的收集与采信：随着信息技术的快速发展，电子证据在职务犯罪案件中的地位日益凸显。但电子证据的收集、保存和鉴定存在诸多技术难题，如数据恢复、篡改检测等。因此，如何确保电子证据的真实性和完整性，是办理此类案件的一个技术挑战。

四. 法律适用的疑难问题

1. 与相似罪名的界限划分：职务犯罪与其他罪名（如盗窃罪、诈骗罪等）之间存在一定的相似性，但又有其独特的构成要件。因此，如何准确划分职务犯罪与其他罪名的界限，是办理此类案件的一个法律难题。这要求办案人员深入理解各罪名的构成要件和区别点，并结合具体案情进行综合分析。
2. 法律条文解释的统一性：由于职务犯罪涉及的法律条文较多，且部分条文存在解释上的模糊性，导致在实践中对同一法律条文的解释可能存在差异。因此，如何确保法律条文解释的统一性，是办理此类案件的一个关键问题。这要求司法机关加强司法解释和指导性文件的制定和发布，对职务犯罪的相关概念和规定进行明确界定和统一解释。

综上所述，办理职务犯罪案件需要综合运用法律知识、审计技术和侦查手段等多种方法，确保案件的公正、准确和高效处理。同时，也需要不断加强法律规定、司法解释和跨部门协作等方面的建设和完善，以更好地应对职务犯罪带来的挑战。如有进一步需要，您可以继续咨询我。