工地上二次付清工资证明应由用人单位出具，并需满足一定的法律要求。

一. 证明材料的出具

1. 出具单位：该证明材料应由用人单位（如工地承包商或劳务公司）出具，证明已二次付清工人工资。
2. 内容要求：证明材料中应明确注明工人的姓名、身份证号、工作时段、应发工资、已发工资、二次付清的工资数额及支付时间等关键信息。
3. 签字盖章：根据《最高人民法院关于适用《中华人民共和国民事诉讼法》的解释》第一百一十五条，证明材料应由单位负责人及制作证明材料的人员签名或者盖章，并加盖单位印章，以确保其法律效力。

二. 法律要求的遵循

1. 真实性：用人单位出具的证明材料必须真实、准确，反映实际情况，不得有虚假内容。
2. 合法性：用人单位在支付工资时，应遵守《中华人民共和国劳动法》的相关规定，确保支付的工资不低于当地最低工资标准，且支付方式和时间符合法律要求。

三. 证明材料的使用

1. 用途明确：该证明材料通常用于证明工人工资已全部结清，避免后续出现工资纠纷。因此，在出具时应明确其用途，如用于劳动仲裁、法院诉讼或其他需要证明工资支付情况的场合。
2. 妥善保管：工人和用人单位都应妥善保管该证明材料，以备不时之需。

我建议，在出具二次付清工资证明时，用人单位应严格按照法律要求进行操作，确保证明材料的真实性和合法性。同时，工人也应妥善保管该证明材料，以维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。