建筑工程是否可以接运输费，取决于具体情况和合同约定。以下是对此问题的详细分析：
一. 法律角度的分析
合同自由原则：根据合同法的基本原理，合同双方可以在合同中自由约定各自的权利和义务，包括运费的收取。因此，如果建筑工程合同中明确约定了运费的收取条款，并且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，那么运费的收取就是合法的。
建筑法相关规定：建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位，但必须经过建设单位认可，并且主体结构施工必须由总承包单位自行完成。这表明，建筑工程中的部分工程，包括运输服务，是可以外包的，但必须符合一定的条件。
二. 实际操作中的考量
经营范围与资质：建筑工程公司如果要在合同中约定运输费，首先需要确认其经营范围中是否包含运输服务，并且是否具备相应的运输资质。如果经营范围中没有包含运输服务，或者不具备运输资质，那么收取运输费可能会存在法律风险。
税务处理：根据税法规定，提供交通运输服务需要缴纳增值税。因此，如果建筑工程公司要收取运输费，还需要考虑如何正确计算和缴纳税款。
三. 我的建议
明确合同约定：在建筑工程合同中明确约定运费的收取条款，包括运费的计算方式、支付时间和支付方式等，以确保双方的权益得到保障。
核查经营范围与资质：在接运输费之前，建筑工程公司应该核查自己的经营范围是否包含运输服务，并且是否具备相应的运输资质。如果不具备相关资质，建议避免收取运输费或者寻求与有资质的运输公司合作。
咨询税务专业人员：在涉及运输费的税务处理方面，建议咨询税务专业人员以确保正确计算和缴纳税款。
综上所述，建筑工程是否可以接运输费取决于合同的具体约定、公司的经营范围和资质以及税务处理等多个因素。在实际操作中，建筑工程公司应该谨慎对待并妥善处理相关问题。如有进一步需要，您可以继续咨询我。