工程咨询费取费计算标准主要依据具体的服务内容和项目的复杂程度来确定。具体标准如下：

1. 基础收费标准：造价咨询服务费收费不足5000元时，按5000元收取。这是咨询服务的起步价，确保咨询机构的基本运营成本。

2. 全过程造价控制：若部分阶段的服务内容不实施，则扣减相应阶段的费率。这意味着，如果咨询服务只涉及工程建设的某个或某些阶段，而非全过程，那么费用将相应减少。

3. 复杂系数难度调整：根据项目管理、技术的复杂难度情况，可计取1.1到1.3的复杂系数难度调整系数。对于特别复杂的项目，如涉及新技术、新工艺或特殊要求的，咨询费用将相应增加。相反，对于简易工程，如独立的土石方、软基处理、绿化工程等，可计取0.7到0.9的复杂系数难度调整系数，以降低咨询费用。

4. 取费基数：工程主材、设备无论是否计入控制价、结算价等，均应计入取费基数。这意味着，咨询费用不仅考虑服务内容和项目复杂程度，还与工程实际使用的材料和设备有关。

• 例如，如果一个工程项目涉及复杂的造价管理，且需要使用大量特殊材料，那么咨询费用将相对较高，因为这不仅需要咨询机构投入更多的人力和时间，还需要对特殊材料进行深入研究和分析。

综上所述，工程咨询费取费计算标准是一个综合考虑服务内容、项目复杂程度、材料和设备使用等因素的复杂体系。在实际操作中，应根据具体情况进行计算和协商，以确保咨询费用的合理性和公正性。我建议你在与咨询机构协商费用时，明确服务内容、项目复杂程度以及材料和设备的使用情况，以便更准确地计算咨询费用。如有进一步需要，你可以继续咨询我。