亲子鉴定的身份证复印件用完通常会还给本人。下面我将详细解释这一流程及相关注意事项：

在进行亲子鉴定时，通常需要提供身份证复印件作为身份证明材料。这份复印件是鉴定机构用于核实当事人身份信息的重要文件。然而，一旦鉴定流程完成，这份复印件的留存就不再是必需的，除非有特别的法律规定或当事人自愿同意留存。

从法律角度来看，身份证复印件属于个人隐私信息，应当受到保护。鉴定机构在没有法律依据或当事人同意的情况下，不得擅自留存或泄露这些信息。因此，在亲子鉴定结束后，鉴定机构通常会将身份证复印件退还给当事人，以确保其个人隐私得到妥善保护。

当然，也存在一些特殊情况。比如，如果亲子鉴定结果涉及法律纠纷或诉讼，相关机构可能会根据法律程序要求留存相关材料，包括身份证复印件。但这种情况下，留存复印件是出于法律程序的需要，而非鉴定机构擅自决定。

综上所述，亲子鉴定的身份证复印件用完通常会还给本人。如果当事人发现自己的身份证复印件未被退还或被不当使用，可以向相关部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。