非法入侵他人住宅案件中，只拘留两人可能是因为只有这两人实施了非法入侵行为，或者只有这两人的非法入侵行为被查证属实。具体分析如下：

一. 非法入侵行为的独立性

• 在非法入侵他人住宅的案件中，并非所有参与案件的人员都会被拘留。只有那些实际实施了非法入侵行为，且该行为被查证属实的人员，才会面临法律的制裁。
• 如果案件中涉及多人，但只有部分人实施了非法入侵行为，那么只有这部分人才会被拘留。其他人如果没有实施非法行为，或者其行为不构成非法入侵，那么他们就不会被拘留。

二. 证据的重要性

• 在处理非法入侵案件时，证据是至关重要的。只有那些有充分证据证明实施了非法入侵行为的人员，才会被依法拘留。
• 如果案件中缺乏足够的证据来证明某人的非法入侵行为，那么这个人就不会被拘留。即使他参与了案件，但如果没有确凿的证据，法律也无法对其进行制裁。

三. 法律程序的严谨性

• 法律程序是严谨的，需要确保每一步都符合法律规定。在拘留人员之前，必须确保有充分的证据来证明其非法行为，并且需要经过合法的程序来批准拘留。
• 因此，即使案件中涉及多人，也只有那些经过合法程序查证属实的非法入侵者才会被拘留。

综上所述，非法入侵他人住宅案件中只拘留两人，可能是因为只有这两人实施了非法入侵行为，并且该行为被查证属实。其他人可能没有实施非法行为，或者其行为没有被查证属实，因此没有被拘留。如有进一步需要，您可以继续咨询我。