公司合同纠纷案判决后，应根据判决结果及自身情况，选择履行判决或依法提起上诉、申请再审。以下是对此问题的详细分析：
一. 若对判决结果无异议
- 履行判决：当公司对合同纠纷案的判决结果没有异议，且判决已经生效时，应严格按照判决书的具体要求，切实履行相应的义务。例如，若判决要求支付款项，公司应按时足额支付；若要求交付货物或提供服务，公司也应准时履行。
- 例如，公司因合同违约被判决支付对方公司100万元赔偿金，公司对此无异议，则应在判决生效后的规定时间内，将100万元支付给对方公司。
二. 若对判决结果有异议
- 提起上诉：若公司对一审判决结果不服，可在判决书送达后的十五日内向上一级人民法院提起上诉。上诉需提交上诉状，明确上诉请求与理由等内容。
- 上诉状应详细阐述对一审判决的不满之处，以及希望二审法院如何改判。同时，应附上相关证据以支持上诉请求。
- 申请再审：若认为生效判决有误，如出现新证据、原证据伪造等情况，公司可申请再审。但需注意，申请再审应当在判决发生法律效力后六个月内提出，且再审一般不影响判决的执行，除非再审法院裁定中止执行。
- 例如，公司在判决生效后发现了新的证据，证明一审判决所依据的主要证据是伪造的，此时公司可以向法院申请再审，以维护自身合法权益。
三. 注意事项
保留证据：在整个处理过程中，公司应妥善保留好相关的证据和文件。这些证据和文件在后续可能面临的争议解决中会起到非常重要的作用。
及时行动：无论是履行判决还是提起上诉、申请再审，公司都应及时行动，以免错过法定的期限或影响自身的合法权益。
我建议：公司在处理合同纠纷案判决后，应首先仔细阅读判决书，明确判决结果及依据。然后根据自身情况，选择适当的处理方式。若对判决结果有异议，应及时咨询专业律师，以便更好地维护公司的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。