收费站擅自放行超限车辆是违法的。

一. 法律依据

1. 《中华人民共和国公路法》第五十条：超过公路、公路桥梁、公路隧道或者汽车渡船的限载、限高、限宽、限长标准的车辆，不得在有限定标准的公路、公路桥梁上或者公路隧道内行驶，不得使用汽车渡船。超过公路或者公路桥梁限载标准确需行驶的，必须经县级以上地方人民政府交通主管部门批准，并按要求采取有效的防护措施；运载不可解体的超限物品的，应当按照指定的时间、路线、时速行驶，并悬挂明显标志。

2. 《中华人民共和国公路法》第七十七条：违反本法第四十六条的规定，造成公路、公路附属设施损坏的，由交通主管部门责令停止违法行为，可以处三万元以下的罚款。其中，第四十六条即为关于不得擅自超限行驶的规定。

二. 法律分析

• 收费站作为公路管理的一部分，有责任遵守并执行《中华人民共和国公路法》的相关规定。擅自放行超限车辆，即违反了公路法对超限车辆行驶的限制，构成违法行为。
• 如果因擅自放行超限车辆导致公路、公路附属设施损坏，收费站还可能面临交通主管部门的处罚，包括责令停止违法行为和罚款等。

三. 结论

因此，收费站擅自放行超限车辆是违法的，并且可能面临相应的法律责任。我建议收费站应严格遵守相关法律法规，不得擅自放行超限车辆，以确保公路的安全和畅通。如有进一步需要，您可以继续咨询我。