国有企业非法持有枪支弹药罪的处理，主要依据《中华人民共和国刑法》第一百二十八条的规定。以下是对该问题的详细解答：
一、罪名认定
非法持有枪支弹药罪，是指违反枪支管理规定，非法持有、私藏枪支弹药的行为。国有企业作为单位，如果非法持有枪支弹药，同样构成此罪。此时，单位本身以及直接负责的主管人员和其他直接责任人员都将受到法律的追究。
二、处理措施
对单位的处罚：
- 根据《中华人民共和国刑法》的规定，单位犯非法持有枪支弹药罪的，对单位判处罚金。
对直接责任人员的处罚：
- 对于直接负责的主管人员和其他直接责任人员，将依照非法持有枪支弹药罪的规定处罚。即处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
三、量刑考虑因素
在实际量刑过程中，法院会全面考虑以下因素：
- 持有的枪支弹药数量：持有的枪支弹药数量越多，量刑越重。
- 枪支弹药的种类和性能：军用枪支、以火药为动力发射枪弹的枪支等，其危害性和量刑标准通常高于其他类型的枪支弹药。
- 持有的目的和动机：如果持有的枪支弹药被用于违法犯罪活动，或者持有者具有其他恶劣情节，量刑将相应加重。
- 自首和立功表现：如果单位或个人能够主动向司法机关投案自首，并如实交代罪行，或者具有其他立功表现，可能会获得从轻或减轻处罚的机会。
四、法律建议
- 国有企业应严格遵守国家关于枪支弹药的管理规定，不得非法持有、私藏枪支弹药。
- 一旦发现非法持有枪支弹药的情况，应立即向司法机关报告，并积极配合调查处理。
- 加强内部管理和监督，建立健全枪支弹药管理制度，防止类似违法行为的再次发生。
综上所论，国有企业非法持有枪支弹药罪的处理将依据《中华人民共和国刑法》的相关规定进行，对单位和直接责任人员都将依法追究刑事责任。因此，国有企业应高度重视枪支弹药的管理工作，确保合法合规。