收到被认定虚开的发票，应立即停止使用该发票，并主动向税务部门报告，配合相关调查。具体处理方式如下：

一. 停止使用并报告

收到被认定虚开的发票后，首先应立即停止使用该发票进行任何财务或税务处理。同时，需尽快向当地税务部门报告此情况，说明发票的来源、使用情况等，以便税务部门进行调查。

二. 配合税务部门调查

1. 提供相关资料：根据税务部门的要求，提供与虚开发票相关的所有资料，如交易合同、付款凭证、收货记录等，以证明交易的真实性和发票的取得情况。
2. 接受询问和调查：税务部门可能会就虚开发票的情况进行询问或实地调查，应如实回答并提供必要的协助。

三. 法律责任

1. 可能面临的处罚：如果经税务部门调查确认存在虚开发票的行为，根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条的规定，可能会面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。同时，单位也可能被判处罚金，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员进行处罚。
2. 避免进一步风险：为了避免进一步的法律风险，建议在收到被认定虚开的发票后，及时咨询专业律师或税务顾问，了解具体的法律后果和应对措施。

四. 后续处理

1. 更正税务申报：如果之前已经使用该虚开发票进行了税务申报，应尽快向税务部门申请更正申报，并补缴相应的税款和滞纳金。
2. 加强内部管理：为了避免类似情况再次发生，应加强企业内部的财务管理和发票管理制度，确保所有发票的真实性和合法性。

我建议，在处理此类问题时，务必保持与税务部门的良好沟通，积极配合调查，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如有进一步需要，您可以继续咨询我。