违反竞业协议不一定会留案底。具体分析如下：

一. 违反竞业协议的法律后果

1. 一般情况：如果劳动者违反竞业限制协议，但并未给商业秘密的权利人造成重大损失，那么通常不会构成犯罪，也就不会留案底。

2. 特殊情况：根据《刑法》第二百一十九条，如果劳动者违反竞业限制协议，给商业秘密的权利人造成重大损失的，可能会被判处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。在这种情况下，由于构成了犯罪，因此会留下案底。同样，如果造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金，也会留下案底。

二. 案底的定义与影响

• 案底定义：案底通常指的是一个人是否有犯罪记录，即是否被法院判定有罪并记录在案。
• 案底影响：有案底可能会对个人未来的就业、生活等方面产生一定影响，如在某些行业或职位中可能受到限制。

三. 结论与建议

• 结论：因此，违反竞业协议是否会留案底，取决于是否给商业秘密的权利人造成了重大损失，并因此被法院判定有罪。
• 建议：劳动者在签订竞业限制协议时，应充分了解协议内容，遵守协议约定，以避免可能的法律风险和后果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。