合伙人用赃款投资的行为，其投资款项及收益均属于违法所得，应当依法予以追缴或责令退赔。以下是具体的处理方式和法律依据：

一. 追缴赃款及收益

1. 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，“犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔”。这意味着，无论是直接获得的赃款，还是通过赃款投资获得的收益，都属于违法所得的范畴，应当被依法追缴。

2. 处理方式：相关部门会依法对涉及的投资款项及收益进行查封、扣押或冻结，以确保这些资金不被转移或隐匿。随后，按照法定程序进行追缴，追缴后的资金将依法上缴国库。

二. 公司的应对措施

1. 立即停止使用赃款：一旦公司得知投资款项来源于赃款，应立即停止使用该资金，并配合相关部门的调查。继续使用赃款进行经营活动可能会使公司面临法律责任。

2. 配合调查：公司应积极配合相关部门的调查工作，如实提供必要的证据和信息，以便相关部门能够准确、高效地处理赃款问题。

三. 合伙人的法律责任

1. 不知情情况下的处理：如果合伙人在不知情的情况下使用了赃款进行投资，虽然不构成犯罪，但一旦知情，应立即停止使用该资金，并向公安机关报告。同时，可能需要退还这些资金，即使是无意的。

2. 知情情况下的处理：如果合伙人明知是赃款而故意使用进行投资，则可能构成掩饰、隐瞒犯罪所得罪。根据《中华人民共和国刑法》第三百一十二条的规定，“明知是犯罪所得及其产生的收益而予以窝藏、转移、收购、代为销售或者以其他方法掩饰、隐瞒的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金”。

四. 我的建议

1. 加强尽职调查：公司在接受投资时，应加强对资金来源的尽职调查，确保投资款项的合法性。这有助于避免卷入不必要的法律纠纷。

2. 建立合规机制：公司应建立完善的合规机制，明确禁止接受任何形式的非法资金。同时，加强员工培训和法律意识教育，提高员工对违法行为的识别和防范能力。

3. 及时咨询法律专业人士：如果公司或合伙人发现涉及赃款投资的问题，应及时咨询法律专业人士，以便得到专业的法律建议和帮助。

综上所述，合伙人用赃款投资的行为是违法的，应当依法予以追缴或责令退赔。公司应积极配合相关部门的调查工作，并加强尽职调查和合规机制建设，以防范类似问题的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。