手机丢失在司机车上，赔偿金额应依据手机的具体价值来确定，通常按照损失发生时的市场价格或其他合理方式计算。以下是具体分析：

一. 赔偿原则

1. 依据损失计算：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百八十四条，侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。这意味着，手机丢失在司机车上，赔偿金额应基于手机的市场价值或购买价格（若为新购手机）来确定。
2. 双方协商：在实际操作中，赔偿金额往往由双方协商确定。如果司机同意按照手机的市场价值赔偿，那么双方可以达成赔偿协议。

二. 赔偿金额的确定

1. 市场价值：如果手机是近期购买的，可以参考购买价格作为赔偿依据。如果手机已使用一段时间，可以依据手机品牌、型号、新旧程度等因素，结合当前市场价格来确定赔偿金额。
2. 其他合理方式：如果手机具有特殊意义或价值（如定制手机、纪念版手机等），双方可以协商采用其他合理方式来计算赔偿金额，如考虑手机的情感价值、使用价值等。

三. 特殊情况处理

1. 过错责任：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百八十六条，如果受害人和行为人对损害的发生都没有过错的，那么双方可以协商分担损失。但在此案例中，如果司机明确知晓手机丢失在车上且未采取合理措施归还或通知乘客，那么司机应承担主要赔偿责任。
2. 紧急避险：此情况通常不适用于手机丢失在司机车上的场景。但如果存在特殊情况（如司机为避免更大损失而紧急处理导致手机损坏或丢失），可以依据《中华人民共和国民法典》第一百八十二条关于紧急避险的规定来处理。

我建议，在确定赔偿金额时，双方应充分沟通并协商，考虑手机的具体价值、新旧程度以及双方的责任等因素。如果无法达成一致，可以寻求第三方调解或诉诸法律途径解决。如有进一步需要，您可以继续咨询我。