医疗废物不制作电子转移联单将可能面临行政处罚，具体处理需依据相关法律法规进行。

一. 法律法规依据

1. 《医疗废物管理条例》第十四条：医疗卫生机构和医疗废物集中处置单位，应当依照本条例的规定，执行危险废物转移联单管理制度。医疗卫生机构和医疗废物集中处置单位，应当对医疗废物进行登记，登记内容应当包括医疗废物的来源、种类、重量或者数量、交接时间、处置方法、最终去向以及经办人签名等项目。登记资料至少保存3年。

2. 《医疗废物管理条例》第四十五条：医疗卫生机构、医疗废物集中处置单位违反本条例规定，有下列情形之一的，由县级以上地方人民政府卫生行政主管部门或者环境保护行政主管部门按照各自的职责责令限期改正，给予警告；逾期不改正的，处2000元以上5000元以下的罚款：……（四）未执行危险废物转移联单管理制度的；……

二. 法律分析

根据《医疗废物管理条例》的规定，医疗卫生机构和医疗废物集中处置单位在执行医疗废物处理时，必须执行危险废物转移联单管理制度，即制作医疗废物电子转移联单。若未按规定制作，将可能面临由县级以上地方人民政府卫生行政主管部门或环境保护行政主管部门给予的行政处罚，包括责令限期改正、警告，以及逾期不改正时的罚款。

三. 处理建议

1. 立即改正：如已发现未制作医疗废物电子转移联单的情况，应立即进行补做，并确保今后严格按照规定执行。

2. 配合调查：如已接到相关部门的调查或处罚通知，应积极配合，提供所需资料，说明情况。

3. 加强内部管理：加强对医疗废物处理流程的管理，确保每个环节都符合法律法规的要求，避免类似情况再次发生。

我建议，您应尽快对未制作医疗废物电子转移联单的情况进行整改，并加强内部管理，以确保医疗废物的合规处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。