被告不愿意离婚且希望书面申请不到庭的，需要向法院提交书面意见，并说明不到庭的正当理由，同时可以申请法院进行缺席判决。具体分析如下：

一. 提交书面意见

• 被告如果因特殊原因无法到庭，可以事先向法院提交书面意见，明确表达自己对离婚诉讼的立场和观点。在书面意见中，被告应详细阐述不愿意离婚的理由，以及对于婚姻关系的看法和期望。

二. 说明不到庭的正当理由

• 被告在书面意见中，除了表达不愿意离婚的立场外，还需要详细说明自己无法到庭的正当理由。这些理由可能包括工作、健康、家庭等各方面的特殊情况，导致被告无法亲自出庭应诉。
• 法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》第一百四十六条规定，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，可以按撤诉处理；被告反诉的，可以缺席判决。虽然此条款主要针对原告，但被告若不到庭也应提供正当理由，否则可能影响案件的审理和判决。

三. 申请缺席判决

• 在提交了书面意见并说明了不到庭的正当理由后，被告可以向法院申请缺席判决。缺席判决是指在被告未到庭的情况下，法院根据原告提供的证据和被告的书面意见，对案件进行审理并作出判决。
• 注意：申请缺席判决并不意味着被告可以完全忽视诉讼程序。被告仍然需要关注案件的进展，并在必要时提供补充材料或证据以支持自己的立场。

四. 实际操作建议

• 我建议：被告在撰写书面意见时，应尽可能详细、清晰地阐述自己的观点和理由，同时确保所述内容的真实性和准确性。此外，被告还可以考虑聘请专业律师协助自己处理诉讼事宜，以确保自己的权益得到充分保障。

综上所述，被告不愿意离婚且希望书面申请不到庭的，需要向法院提交详细的书面意见，并说明不到庭的正当理由。同时，可以申请法院进行缺席判决，但应关注案件的进展并必要时提供补充材料或证据。如有进一步需要，您可以继续咨询我。