已办理进京证的外地货车进入北京二环，将被认定为“机动车违反禁令标志指示”的违法行为，处100元罚款，并记3分。具体分析如下：

一. 已办理进京证的外地货车的限行规定与处罚

1. 限行规定：根据北京市的交通规定，已办理进京通行证件的外省、区、市载货汽车，在6时至24时期间，是禁止在六环路（不含）以内道路行驶的，这包括了二环主路。
2. 处罚措施：若违反上述限行规定，将被认定为“机动车违反禁令标志指示”的违法行为，依据相关法规，将处以100元罚款，并记3分。

二. 法律依据

• 此处罚措施是基于北京市对于外地货车进入城区的限行政策，以及《中华人民共和国道路交通安全法》中关于违反交通规定的相关处罚条款。虽然直接引用的《中华人民共和国道路交通安全法》第九十三条并未直接提及此具体情形，但它是关于违反交通规定处罚的一般性条款，而具体的限行和处罚规定则是由北京市的交通管理部门根据当地实际情况制定的。

三. 建议与总结

• 我建议：外地货车司机在进京前，应详细了解并遵守北京市的交通限行规定，合理规划行驶路线，以避免因违规而受到处罚。
• 如有其他关于交通法规或行车路线的问题，您可以继续咨询我，我将尽力为您提供帮助。