刚怀孕3个月可以做亲子鉴定。但需要注意的是，进行亲子鉴定存在一定的风险，且不同鉴定方法的适用时间和风险程度也有所不同。以下是对此问题的详细分析：
一. 亲子鉴定的方法
无创亲子鉴定：这种方法通常是通过采集孕妇的静脉血和假定父亲的样本进行DNA比对。无创亲子鉴定的原理是利用孕妇血液循环系统中胎儿的DNA信息。这种鉴定方法不会对孕妇或胎儿造成伤害，因为它仅仅涉及血液中的DNA，而不是细胞。无创亲子鉴定的操作通常不需要特殊的药物治疗。然而，无创亲子鉴定虽然相对安全，但仍存在一些风险和限制。
羊水穿刺亲子鉴定：这种方法通常是在怀孕满16周后，通过腹部穿刺羊水进行鉴定。羊水穿刺属于一个有创手术，具有一定的风险，可能导致宫腔感染或其他并发症。但相对于无创亲子鉴定，羊水穿刺的准确性更高。
绒毛采集亲子鉴定：这种方法一般在怀孕12-14周进行，由医生在B超引导下采集胎儿绒毛组织。然而，绒毛采集的风险较大，易导致流产。
二. 风险与注意事项
风险提醒：无论是哪种亲子鉴定方法，都存在一定的风险。特别是羊水穿刺和绒毛采集这两种有创方法，可能会对孕妇和胎儿造成一定的伤害。因此，在进行亲子鉴定前，务必充分了解风险并谨慎决定。
选择正规机构：进行亲子鉴定时，应选择正规、有资质的医疗机构进行。这样可以确保鉴定结果的准确性和可靠性，同时也能最大程度地降低风险。
三. 我的建议
鉴于刚怀孕3个月的情况，我建议优先考虑无创亲子鉴定。这种方法相对安全且方便，不会对孕妇和胎儿造成太大影响。如果确实需要进行更准确的鉴定，可以考虑在怀孕满16周后选择羊水穿刺亲子鉴定。但在此之前，务必充分了解风险并谨慎决定。
最后，请注意在怀孕期间保持良好的心情和充足的睡眠，避免过度劳累和剧烈运动。如有进一步需要或疑问，您可以继续咨询我。