关于您提出的“补充协议需重新约定合同金额是否需要缴纳印花税”的问题，这确实是一个涉及税务合规性的重要议题。以下是对此问题的详细解答：
核心要点：
补充协议是否需要缴纳印花税，主要取决于其是否改变了原合同的应税金额、交易性质或添加了新的应税项目。
详细分析：
改变应税金额：
- 如果补充协议导致原合同的应税金额发生变化（无论是增加还是减少），那么通常需要对变化的部分进行相应的印花税处理。特别是当金额增加时，需就增加的部分补缴印花税。
- 值得注意的是，即使补充协议导致合同金额减少，已缴纳的印花税通常也不会退还或抵缴。
未改变应税金额：
- 如果补充协议仅仅是对原合同的一些非主要条款进行补充或说明，比如明确运输方式、交货地点等，并未涉及合同金额的调整或产生新的应税事项，那么通常不需要再次缴纳印花税。
构成新的应税合同或添加新应税项目：
- 如果补充协议在实质上构成了一份新的独立合同，或者增加了新的应税项目，那么需要对新增的应税项目或合同金额按规定缴纳印花税。
地区差异与咨询建议：
- 税务规定在不同地区可能存在差异，因此在实际操作中，建议咨询当地税务机关或专业律师，以获取准确的税务指导和建议。这样可以确保您的税务处理符合当地法规要求，避免不必要的税务风险。
总结：
综上所述，补充协议是否需要缴纳印花税，应基于其具体内容和性质进行判断。如果补充协议改变了原合同的应税金额、交易性质或添加了新的应税项目，那么需要依法缴纳印花税。如果仅为非实质性的补充或说明，则通常无需缴纳。考虑到地区差异和税务合规性的重要性，建议在实际操作中咨询当地税务机关或专业律师以确保合规处理。