一家三口父子和母子亲子鉴定在本质上是一样的。

一. 亲子鉴定原理相同

亲子鉴定遵循孟德尔遗传规律，即子女的基因型一半来自父亲，一半来自母亲。无论是鉴定父子关系还是母子关系，都是基于这一遗传学原理，通过比对孩子与父母的DNA来确定亲子关系。

二. 鉴定流程与标准一致

1. 选择鉴定机构：需要选择具有司法鉴定资质的鉴定机构，以确保鉴定结果的法律效力。
2. 提供身份证明：参与鉴定的各方需要提供有效的身份证明，如身份证、户口本等。
3. 委托鉴定与缴费抽样：通过法院、法律事务所或直接向鉴定机构办理委托手续，并按照要求缴纳费用，在指定时间地点进行抽样。
4. 实验室鉴定：鉴定机构在收到样本后，会在实验室进行鉴定，核对当事人的身份及委任状。
5. 出具鉴定报告：鉴定完成后，鉴定机构会出具鉴定报告，该报告将作为亲子关系的法律依据。

在这个过程中，无论是鉴定父子关系还是母子关系，都是按照上述流程进行的，且遵循相同的鉴定标准。

三. 鉴定结果的准确性

亲子鉴定的精准率非常高，无论是父子或母子两人单亲亲子鉴定，还是父母子三人三联体亲子鉴定，所确认的亲子关系至少在99.99%以上。这意味着，无论是哪种类型的亲子鉴定，只要按照正确的流程和方法进行，都能得到准确的结果。

四. 特殊情况处理

虽然父子和母子亲子鉴定的基本原理和流程相同，但在某些特殊情况下，如存在基因突变等，可能需要增加检测基因座位点或进行其他特殊处理。然而，这种情况较为罕见，且鉴定机构通常会有相应的应对措施来确保鉴定结果的准确性。

我的观点：从法律和实践的角度来看，一家三口进行的父子和母子亲子鉴定在本质上是一样的，都遵循相同的遗传学原理、鉴定流程和标准，且都能得到准确的结果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。