亲子鉴定主要使用双方的DNA样本进行鉴定。具体分析如下：

一. 亲子鉴定的材料

• 亲子鉴定是通过对比双方的DNA样本来确定亲子关系的。因此，进行亲子鉴定时，需要提取双方的DNA样本，如血液、毛发、口腔黏膜细胞等。
• 在实际操作中，常见的样本类型包括血液样本（通常采指尖血）、毛发样本（需带有毛囊）、口腔黏膜细胞样本（通过棉签擦拭口腔内壁获取）等。

二. 法律依据与解释

• 虽然《中华人民共和国民法典》第一千零四十五条定义了亲属关系，包括血亲，但并未具体规定亲子鉴定的具体材料和流程。
• 亲子鉴定的具体材料和要求通常由鉴定机构根据专业标准和实际操作经验来确定。
• 需要注意的是，亲子鉴定应遵守相关法律法规，确保鉴定过程的合法性和结果的准确性。

三. 总结与建议

• 我建议，在进行亲子鉴定前，应咨询专业的鉴定机构，了解具体的样本要求和鉴定流程。
• 同时，确保所提供的样本真实可靠，以免影响鉴定结果的准确性。
• 如有进一步需要，您可以继续咨询我。