流下来的两个月孕囊在一定条件下可以做亲子鉴定。但需要注意的是，这涉及到多个方面的因素，包括法律、伦理、技术以及实际操作的可行性。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律与伦理考量

1. 法律合规性：进行亲子鉴定必须遵循当地的法律法规，确保整个过程的合法性和合规性。
2. 伦理问题：亲子鉴定涉及个人隐私、家庭关系等伦理问题，需要谨慎处理，特别是在涉及未出生胎儿或流产物的情况下。

二. 技术可行性

1. 胚胎组织保存：如果流产后的孕囊组织保存得当，没有受到污染和破坏，是进行DNA鉴定的重要前提。
2. 鉴定技术与设备：目前存在先进的DNA检测技术和设备，能够对胚胎组织进行准确的分析。但需要注意的是，由于怀孕两个月时胚胎样本极少，提取DNA样本信息可能存在一定的难度。

三. 实际操作的复杂性

1. 样本采集：在孕囊流出后，需要尽快送检，并确保样本的完整性和纯净性，以便进行准确的DNA分析。
2. 鉴定机构选择：应选择有资质、专业可靠的鉴定机构进行检测，以确保鉴定结果的准确性和可靠性。

四. 我的观点与建议

1. 谨慎决定：鉴于亲子鉴定涉及法律、伦理和技术等多个方面，建议在决定进行鉴定前充分咨询医生、律师等相关专业人士，并权衡利弊。
2. 尊重生命：每个生命都值得尊重，无论是在怀孕过程中还是流产后。如果孕囊已经流出，建议在没有必要的情况下尽量避免进行亲子鉴定，以免对已经逝去的生命造成进一步的伤害。

综上所述，流下来的两个月孕囊在一定条件下可以做亲子鉴定，但需要考虑多种因素。如有进一步需要，您可以继续咨询我。