孤儿黑户被发现后，应依据《中华人民共和国户口登记条例》的相关规定进行处理。具体处理方式如下：
一. 核实身份与告知程序
核实身份：警方首先会核实该孤儿的身份信息，确认其是否为黑户。这一步骤可能包括询问该孤儿（如果年龄足够大能够理解）、调查其居住地等。
告知程序：如果确认为黑户，警方通常会告知相关人员（如福利院、收养人等）到公安局户籍部门申请户口注册。
二. 申请户口注册
收养人申请：如果是被收养的孤儿，收养人需要向当地的户口登记机关申报孤儿的出生登记。这通常要求收养人先向民政部门提出收养申请，并提交相关证明材料，如收养人的身份证明、经济状况证明以及孤儿的身份证明（如果可能的话）等。民政部门审核通过后，会颁发《收养登记证》。收养人需携带此证及自己的居民户口簿，到户口登记机关申请办理孤儿的常住户口登记。
福利院申请：如果是福利院收养的弃婴，福利院作为育婴机关，有责任向户口登记机关申报该孩子的出生登记。
三. 特殊情况的处理
未办理收养手续的事实收养：对于未办理收养手续的事实收养无户口孤儿，当事人可以向民政部门申请按照规定办理收养登记，然后凭申领的《收养登记证》、收养人的居民户口簿，申请办理常住户口登记。
其他无户口情况：对于因各种原因（如政策外生育、非婚生育、未办理出生证明等）而成为黑户的孤儿，可以凭相关证明（如《出生医学证明》、父母一方的居民户口簿、结婚证或者非婚生育说明等）申请办理常住户口登记。具体流程可能因地区而异，但总体原则是遵循《中华人民共和国户口登记条例》的相关规定。
四. 保护合法权益
在处理孤儿黑户问题时，应特别注意保护该孤儿的合法权益。尽管黑户可能因为没有身份证明而面临一些生活上的困难，但警方和相关部门不会因此而对其进行歧视或侵犯其权益。
我的观点：孤儿黑户问题是一个涉及儿童权益保护的重要问题。相关部门应积极采取措施，确保每个孤儿都能获得合法的户口登记，从而享受公民应有的权利和待遇。同时，也建议社会各界给予孤儿更多的关注和帮助，让他们能够更好地融入社会。如有进一步需要，您可以继续咨询我。