关于自然人股东申请调取工商登记原始档案的法律依据，我可以为你提供以下详细解答：
核心结论：自然人股东在特定情况下有权申请调取工商登记原始档案，这一权利主要依据《中华人民共和国公司法》及相关行政法规、部门规章得以确立。
具体法律依据：
《中华人民共和国公司法》：
- 虽然《公司法》并未直接规定自然人股东调取工商登记原始档案的具体程序，但它确立了股东对公司经营情况的知情权和查阅权。这些权利为股东申请调取相关档案提供了法律基础。
《中华人民共和国公司登记管理条例》：
- 该条例规定了公司登记档案的保管、查询等事项。根据条例，公司登记机关应当建立公司登记档案，并允许相关主体依法查询。虽然条例未直接提及自然人股东的查询权，但结合《公司法》的股东知情权，可以推断自然人股东在符合法定条件时有权查询公司登记档案。
《企业信息公示暂行条例》及其实施细则：
- 这些法规规定了企业信息的公示和查询制度。虽然它们主要关注的是企业信息的公开透明，但也为自然人股东查询公司相关信息（包括工商登记信息）提供了一定的法律支持。
部门规章及地方性法规：
- 某些部门规章和地方性法规可能进一步细化了公司登记档案的查询程序和要求。例如，一些地方的工商行政管理部门可能制定了具体的查询办法，明确了查询的主体、条件、程序等。
实践操作建议：
- 在申请调取工商登记原始档案时，自然人股东应首先明确自己的查询目的和需求，并准备好相关的证明材料（如身份证明、股东资格证明等）。
- 股东应前往公司登记机关或指定的查询机构进行申请，并按照规定的程序和要求提交查询申请及所需材料。
- 如遇查询受阻或结果不符等情况，股东可以依法向相关部门投诉或寻求法律救济。
综上所述，自然人股东在特定情况下有权申请调取工商登记原始档案，这一权利受到《公司法》及相关行政法规、部门规章的保护。在实践操作中，股东应遵守相关法律法规的规定，并按照规定的程序和要求进行申请和查询。