针对“不签第三方协议不给毕业证是否违法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

首先，从教育部的相关规定来看，明确指出了“四不准”的就业工作要求，其中特别提到“不准将毕业证书、学位证书发放与毕业生签约挂钩”。这意味着，高校不能将毕业生是否签订第三方协议作为发放毕业证书的条件，这样的做法违反了教育部的规定。

其次，从实际案例来看，有些学生在毕业时选择了专升本、自主创业、灵活就业等方式，并未签订第三方协议，但学校却因此拒绝发放毕业证。这种做法不仅损害了学生的合法权益，也违背了教育公平和就业公平的原则。实际上，学生的毕业资格应该基于其学业成绩和是否满足毕业要求，而不是是否签订了第三方协议。

再者，从法律角度来看，如果学校因为学生未签订第三方协议而拒绝发放毕业证，这可能构成对学生合法权益的侵犯。学生可以通过法律途径维护自己的权益，例如向教育部门投诉、寻求法律援助或提起诉讼等。

综上所述，不签第三方协议不给毕业证是违法的。高校应该严格遵守教育部的相关规定，不得将毕业证书与签约挂钩，确保学生的合法权益得到保障。同时，学生也应该了解自己的权益，如果遇到类似问题，可以积极寻求法律途径维护自己的合法权益。