在公司有债务且法人代表跑路的情况下，股东想要退出公司，需要遵循一系列有序且合法的步骤。以下是为股东提供的详细指导：

一、明确公司债务与股东责任

首先，股东需要明确，尽管法人代表跑路，但公司作为一个独立的法律实体，其债务并不会因此消失。股东的责任范围取决于公司的类型：在有限责任公司中，股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；在股份有限公司中，股东则以其认购的股份为限对公司承担责任。

二、了解公司财务状况

股东应尽快查阅公司的财务报表、合同等资料，全面了解公司的财务状况和债务状况。如有必要，可聘请专业的会计师或审计师进行财务审计，以确保信息的准确性。

三、考虑股权转让

1. 寻找受让方：股东可以通过股权转让的方式退出公司。在此过程中，需要寻找一个愿意受让股权的买家。
2. 协商并签订协议：与受让方协商股权转让的价格、条件等，并明确告知公司的负债情况。双方达成一致后，签订股权转让协议。
3. 办理工商变更登记：在股权转让协议签订后，需按照相关规定办理工商变更登记手续，以确保股权转让的合法性。

四、与债权人沟通

股东应主动联系债权人，解释当前情况，并表明愿意积极解决问题。尝试与债权人达成债务重组、延期还款或其他解决方案，以减轻公司负担并维护公司信誉。

五、考虑公司重组或清算

1. 公司重组：若公司无法偿还债务，但仍有挽救价值，股东可考虑重组措施，如重新安排债务、引入新投资者或改变公司业务结构等。
2. 公司清算：若公司无法继续运营，股东应考虑清算选项。清算过程中，公司资产将被变现以偿还债务，并结束公司运营。股东需按照法律规定参与清算过程。

六、特殊情况下股东的责任

股东在退出公司时，若存在出资不实、抽逃出资或滥用公司法人独立地位和股东有限责任等行为，可能需承担额外的法律责任。因此，股东在退出过程中应确保自身行为的合法性。

七、咨询专业律师

在整个过程中，股东应咨询专业律师以获取法律建议和指导。律师将帮助股东了解自身权利和义务，协助处理与债权人的谈判、股权转让协议签订以及可能的法律程序等。

综上所述，股东在公司有债务且法人代表跑路的情况下想要退出公司，需要明确自身责任与权利，采取积极的应对措施，并遵循相关法律法规和公司章程的规定。通过股权转让、与债权人沟通、考虑公司重组或清算等方式来解决问题，并在此过程中注意保护自身的合法权益。