如果花呗逾期被起诉后已经还清，案件不一定会自动取消。具体情况需要从以下几个角度来分析：

1. 案件进展阶段：

   • 如果在起诉后、法院判决前还清了花呗欠款，原告（通常是花呗的债权方）可能会考虑撤诉，但这需要原告主动向法院提出撤诉申请，并得到法院的批准。
   • 如果案件已经进入了判决阶段，法院已经做出了判决，即使还清了欠款，判决仍然有效。此时，还清欠款只是履行了判决，但案件本身不会因此取消。

2. 法律程序：

   • 法律程序一旦启动，就需要按照法律的规定进行。还清欠款是履行债务的行为，但并不能直接导致法律程序的终止。
   • 如果原告坚持继续诉讼，即使欠款已经还清，案件仍会继续进行，直到法院作出最终判决或裁定。

3. 诉讼费用和律师费用：

   • 即使还清了欠款，原告已经支付的诉讼费用和律师费用通常不会退还。
   • 被告如果因为诉讼产生了费用，也需要自行承担。

4. 信用记录：

   • 花呗逾期被起诉的记录可能会对个人信用记录产生负面影响。
   • 还清欠款后，虽然解决了债务问题，但信用记录的恢复需要一段时间，并且可能需要采取额外的措施来修复。

因此，如果你花呗逾期被起诉后已经还清欠款，建议主动与原告（花呗的债权方）沟通，了解他们是否愿意撤诉。同时，也可以咨询法院或专业律师，了解案件的具体进展和可能的法律后果。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。