取保候审期间发工资是合法的，但具体情况需根据实际劳动情况和单位规章制度综合判断。

1. 若员工正常提供劳动：

   • 取保候审期间，犯罪嫌疑人或被告人并未被剥夺劳动的权利，其仍可正常工作并获得相应报酬。
   • 若员工在取保候审期间仍正常为单位提供劳动，用人单位按照正常的劳动制度和薪资规定支付工资是合法合理的。

2. 若员工无法正常工作：

   • 若员工因案件侦查、审理需要频繁配合调查，导致无法到岗工作，单位可根据实际情况和规章制度，对工资进行相应调整，如按事假处理或支付部分生活费等。
   • 在此情况下，单位扣减工资有一定合理性，但应确保规章制度合法合规，且经过民主程序制定并公示。

3. 单位规章制度的合法性：

   • 单位的规章制度应合法合规，若规章制度明确规定员工在取保候审期间工资发放办法，且该制度经过民主程序制定并公示，那么在符合规定的情况下扣工资或被认定合法。

4. 员工维权途径：

   • 若员工认为单位扣工资不合理，可与单位协商，协商不成可通过劳动仲裁等途径维权。

综上所述，取保候审期间发工资的合法性需根据员工实际劳动情况和单位规章制度综合判断。若员工正常提供劳动，单位应支付工资；若员工无法正常工作，单位可根据规章制度进行相应调整。在任何情况下，单位的规章制度都应合法合规，并确保员工的合法权益得到保障。