诉前保全后双方达成调解，可以按照以下流程进行处理：

首先，若调解成功且纠纷得到解决，申请人应及时向实施保全措施的人民法院提出解除保全的申请。这是因为保全的目的是为了确保判决或调解协议的执行，既然双方已经达成调解，保全的目的就已经达成，因此没有必要继续维持保全措施。

法院在收到解除保全的申请后，会进行审查。如果认为申请合理且符合法律规定，法院会裁定解除保全，并及时解除对被保全财产的查封、扣押、冻结等措施。这一步骤是确保当事人的合法权益得到及时恢复。

其次，如果调解协议中涉及给付内容，双方可以要求法院出具调解书。调解书具有与判决书同等的法律效力，具有强制执行力。如果一方不履行调解书确定的义务，另一方可以向法院申请强制执行，以确保调解协议得到履行。

此外，如果在调解过程中，申请人放弃部分权利或变更保全请求，也应及时告知法院。法院会根据新的情况对保全措施作出相应的调整，以保障当事人的合法权益和调解协议的顺利履行。

总的来说，诉前保全后双方达成调解的处理流程包括：提交解除保全申请、法院审查并裁定解除保全、根据需要出具调解书、以及根据调解协议履行情况调整保全措施等步骤。这些步骤共同确保了当事人的合法权益得到及时有效的保护，同时也促进了调解协议的顺利履行。