首先，我们需要明确一点：如果一艘有证书的船舶被股东擅自注销，那么这很可能涉及到侵犯其他股东或公司权益的行为，因此，在符合一定条件下，是可以对这位股东提起诉讼的。

接下来，我们详细分析这个问题：

1. 船舶的所有权与注销：

   • 船舶作为财产，其所有权归属通常会在公司章程、股东协议或相关法律文件中明确。
   • 注销船舶通常需要遵循一定的法律程序，并可能需要得到公司其他股东或相关机构的同意。

2. 股东的责任：

   • 如果股东擅自注销船舶，可能违反了公司章程、股东协议或相关法律规定。
   • 这种行为可能损害了公司或其他股东的利益，特别是如果船舶是公司的重要资产或运营工具。

3. 提起诉讼的条件：

   • 你需要证明股东擅自注销船舶的行为违反了公司章程、股东协议或相关法律规定。
   • 你需要证明这一行为对你或其他股东造成了实际损害。
   • 你需要确保你的诉讼请求符合当地法律对诉讼主体、诉讼标的和诉讼程序的要求。

4. 可能的法律后果：

   • 如果诉讼成功，擅自注销船舶的股东可能需要承担赔偿责任，包括恢复船舶原状或赔偿因此造成的经济损失。
   • 此外，股东还可能面临法律责任，如被追究违约责任或侵权责任等。

综上所述，如果你认为有证书的船舶被股东擅自注销，且这一行为违反了公司章程、股东协议或相关法律规定，并对你或其他股东造成了实际损害，那么你可以考虑对这位股东提起诉讼。在提起诉讼前，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。当然，如果你有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。