市场监督管理局在产品质量法中计算违法所得时，主要遵循的是2021年修订的《中华人民共和国行政处罚法》第二十八条第二款的规定。根据这一规定，“违法所得是指实施违法行为所取得的款项。法律、行政法规、部门规章对违法所得的计算另有规定的，从其规定。”以下是对违法所得计算方法的详细解释：

一、违法所得的基本计算方法

违法所得通常是指行为人通过违法销售不合格产品所获得的全部销售收入，在扣除合理进货成本后的余额。这里的“不合格产品”指的是不符合保障人体健康和人身、财产安全的国家标准、行业标准或其他相关质量标准、安全要求的产品。

在具体操作中，违法所得的计算方式为：销售不合格产品的全部收入减去该批产品的合理进货成本。例如，若商家购进一批不合格产品，进价总计为A元，并以B元的总价全部售出（B>A），则其违法所得为B-A元。

二、计算时需要考虑的因素

1. 合理成本的扣除：

   • 在计算违法所得时，应扣除合理进货成本，但需严格审查成本支出的合理性及合法性。
   • 未付款项（如原材料款、工人工资、水电费、运输费等）若债权人有充分证据证明对违法行为不知情，且在当事人支付后，可不计入违法所得。
   • 已经向国家缴纳的税费应凭票据从违法所得中扣除。

2. 特殊情形的处理：

   • 对于不予处罚的案件，虽然违法所得应坚持没收的普遍性，但计算时可以采用“纯利说”，即扣除所有合理成本。
   • 食品抽检不合格案件中，若提供的样品并非真正意义上的交易行为，则样品费用不应计入违法所得。
   • 价格违法案件的违法所得计算应回归常识，以违法行为开始和调查终结时间为节点，计算在此期间实施违法行为所获款项。

三、法律后果与责任承担

1. 行政责任：

   • 销售不合格产品的，将面临责令停止销售、没收违法销售的产品、并处以违法销售产品货值金额百分之五十以上三倍以下的罚款等行政处罚。
   • 若存在违法所得，还将被并处没收违法所得。
   • 情节严重的，甚至可能被吊销营业执照。

2. 刑事责任：

   • 如果销售不合格产品的行为构成犯罪，如生产、销售不符合安全标准的产品罪，并造成严重后果，将依法追究刑事责任。

综上所述，市场监督管理局在计算产品质量法中的违法所得时，应严格遵循相关法律法规的规定，确保计算的准确性和合理性。同时，对于特殊情形和合理成本的扣除也应有明确的判断和处理标准。