办理中医门诊部营业执照的流程，首先您需要明确，根据《中华人民共和国中医药法》和《中医诊所备案管理暂行办法》，举办中医诊所是需要在所在地县级人民政府中医药主管部门进行备案的。以下是具体的办理流程：

1. 准备材料：您需要准备的材料包括但不限于中医诊所的名称、地址、诊疗范围、人员配备情况等。这些材料需要真实、完整，并且清晰可见。
2. 在线填报：登录相关的政务服务网站，按照要求在线填写相关信息，并上传准备好的材料。
3. 提交备案：确认信息无误后，提交备案申请。此时，备案人应对网上备案材料的真实性及电子材料和纸质材料的一致性作出承诺并承担主体责任。
4. 受理与审查：提交后，相关部门会对您的申请进行受理和审查。这个过程通常需要一定的时间，具体时限可能因地方而异。如果材料符合条件，将会被受理；如果不符合条件，将会被退回。
5. 决定与发证：经审查符合规定的，相关部门会发放《中医诊所备案证》。您可以在指定的时间和地点领取证书，或者选择邮寄送达。
6. 公示与执业：取得《中医诊所备案证》后，您需要将诊所的诊疗范围、中医医师的姓名及其执业范围在诊所的明显位置进行公示，并且不得超出备案范围开展医疗活动。

此外，根据您的实际情况，可能还需要办理其他相关的证照和手续，例如建设工程消防验收意见书、建设工程竣工验收消防备案凭证等。这些具体的流程和材料可能因地方和政策的不同而有所差异，建议您在办理前详细咨询当地的相关部门或者专业的服务机构。