人民币目前50元面额的纸币只有一种版本。

50元人民币是我国发行的一种面额较大的纸币，其设计、印制和发行都受到中国人民银行的严格监管。在当前流通的人民币中，50元面额的纸币具有统一的规格、图案和防伪特征。虽然随着时间的推移，人民币的防伪技术不断更新，但50元面额的纸币在版本上并未发生更迭，仍然保持着一种版本的流通状态。

因此，对于“人民币目前50元有多少种”这一问题，答案是明确的：只有一种版本。