取保候审结束后，检察院会根据案件的具体情况和证据，采取以下几种处理方式：

首先，如果经过侦查，检察院发现犯罪嫌疑人并没有实施犯罪行为，或者存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形之一，如情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪等，那么检察院会作出不起诉的决定。这意味着案件就此终结，犯罪嫌疑人不再面临刑事追诉。

其次，如果检察院认为犯罪事实清晰明确，掌握的证据真实、充分，并且犯罪嫌疑人依法应当被追究刑事责任，那么检察院会向法院提起公诉。这意味着案件将进入审判阶段，由法院对犯罪嫌疑人进行审判，并作出相应的判决。

最后，如果检察院认为案件现有的证据不够充足，或者存在其他需要进一步补充证据的情况，那么检察院会把案件退回给公安机关，要求其进行补充侦查。补充侦查最多进行两次，每次时间限制为一个月。公安机关补充侦查完毕后，将案件再次移送检察院，检察院会重新计算审查起诉的期限，并根据补充侦查的情况作出相应的处理决定。

综上所述，取保候审结束后检察院的处理方式会受到案件证据、事实等多方面因素的影响。检察院会依法依规对案件进行审查和处理，确保案件的公正、公平和合法。