医疗机构申请开设药店并不是一个直接由医疗机构到药店的转变过程，而是需要按照相关规定和流程新设立一个药品零售企业。以下是根据您提供的信息以及相关规定，整理出的详细步骤和注意事项：
一、了解相关政策与法规
- 药品经营监督管理办法：熟悉并理解国家药监局及地方药品监督管理部门关于药品经营的相关政策、法规和要求。
- 医保定点药店政策：如果计划申请成为医保定点药店，还需了解并满足医保部门的相关政策和条件。
二、准备申请材料
药品经营许可证申请：
- 企业名称预先核准通知书或营业执照复印件。
- 法定代表人或负责人的身份证明及学历证明。
- 药品经营质量管理规范文件。
- 经营场所的产权证明或租赁合同。
- 药学技术人员的资格证明及劳动合同。
- 其他根据当地药品监督管理部门要求提供的材料。
医保定点药店申请（如适用）：
- 《定点零售药店申请表》。
- 药品经营许可证、营业执照等复印件。
- 药学技术人员相关证书及劳动合同复印件。
- 医保管理人员劳动合同复印件。
- 内部管理制度和财务制度文本。
- 信息系统相关材料。
- 医疗保障基金使用预测性分析报告。
三、提交申请并等待审核
- 向药品监督管理部门提交申请：将准备好的申请材料提交至当地药品监督管理部门，并等待初审。
- 现场评估与审核：药品监督管理部门会对申请企业的经营场所、设施、人员等进行现场评估，并审核申请材料。
- 公示与备案：审核通过后，相关部门会进行公示，无异议后颁发药品经营许可证，并进行备案。
四、满足医保定点条件（如适用）
如果计划申请成为医保定点药店，在获得药品经营许可证后，还需满足医保部门的相关条件，如经营时间、药学技术人员配备、医保管理制度等，并提交相关申请材料进行审核。
五、注意事项
- 合规经营：在申请和运营过程中，必须严格遵守国家及地方的药品经营法规和规定，确保合规经营。
- 人员配备：根据经营规模和品种，合理配备药学技术人员，并确保其具备相应的资格和专业知识。
- 质量管理：建立完善的药品经营质量管理体系，确保药品的质量和安全。
- 信息化建设：根据要求，配备符合规定的信息系统，实现与医保信息系统的有效对接。
综上所述，医疗机构申请开设药店需要遵循一定的流程和要求，包括了解相关政策与法规、准备申请材料、提交申请并等待审核以及满足医保定点条件（如适用）等。在申请和运营过程中，必须严格遵守相关规定，确保合规经营和药品的质量与安全。