在医疗机构更名后，医师的执业注册确实可能需要重新办理。以下是对这一问题的详细解答：

首先，我们需要明确，国家实行医师执业注册制度。医师在取得医师资格后，需要向所在地县级以上地方人民政府卫生健康主管部门申请注册，以获得《医师执业证书》。这是医师合法执业的凭证。

当医疗机构发生更名时，涉及到医疗机构的执业许可、名称变更等一系列法律程序。这些变更可能会影响到医师的执业注册信息，因为医师的执业注册是与特定的医疗机构相关联的。

具体来说，如果医疗机构更名导致原注册信息中的医疗机构名称发生变化，那么医师的执业注册信息也需要相应地进行更新。这通常包括向卫生健康主管部门提交相关材料，如新的医疗机构执业许可证、医师执业变更申请等，以重新办理执业注册。

此外，根据《医师执业注册管理办法》的相关规定，医师变更执业地点、执业类别、执业范围等注册事项的，也需要通过国家医师管理信息系统提交医师变更执业注册申请及省级以上卫生计生行政部门规定的其他材料。虽然医疗机构更名不一定涉及执业地点、执业类别、执业范围的变更，但名称的变更仍然需要按照相关规定进行注册信息的更新。

综上所述，医疗机构更名后，医师的执业注册信息可能需要重新办理或更新。具体流程和要求可能因地区和政策的不同而有所差异，建议咨询当地卫生健康主管部门或相关机构以获取准确的信息和指导。