流产出来的孕囊一般不可以做亲子鉴定。亲子鉴定通常需要在孩子出生后，使用孩子的血液、毛发等样本与父母的样本进行比对。而在流产的情况下，孕囊虽然包含胎儿的遗传信息，但由于其发育阶段和样本特性的限制，通常并不适用于进行亲子鉴定。

从医学和法学的角度来看，亲子鉴定需要确保样本的准确性和可靠性。流产出来的孕囊由于经历了流产过程，可能已经受到了污染或破坏，这会影响鉴定结果的准确性。此外，孕囊中的遗传信息可能尚未完全发育，这也可能增加鉴定的难度和不确定性。

因此，如果你需要进行亲子鉴定，建议在孩子出生后，选择正规的鉴定机构，使用合适的样本进行鉴定。如果你有任何关于亲子鉴定或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询，我会尽力为你提供专业的解答和建议。