当遇到农村土地纠纷导致青苗被毁坏的情况时，您可以按照以下步骤处理：
一、及时固定证据
首先，您需要立即采取行动来固定证据，以便后续维权。这包括但不限于：
拍照或录像：使用相机或手机对青苗被毁坏的情况进行详细的拍照或录像，确保能够清晰地展示青苗的受损程度和范围。
收集其他相关证据：如有可能，收集目击者证言、土地承包合同、相关书面通知或文件等，以证明土地纠纷的存在以及对方毁坏青苗的事实。
二、与对方沟通协商
在固定了充分的证据后，您可以尝试与对方进行沟通协商，寻求和解。您可以向对方明确表达您的诉求，要求其承担赔偿责任，包括恢复青苗原状或支付相应的经济损失。在协商过程中，保持冷静和理性，尽量通过和平方式解决问题。
三、申请仲裁或提起诉讼
如果与对方的协商未能达成一致，您可以向当地的农村土地承包仲裁机构申请仲裁。在申请仲裁时，您需要提交相关证据和材料，并依据《农村土地承包法》等相关法律法规，阐述您的诉求和理由。仲裁机构将依法进行裁决，该裁决具有法律效力，对方应当履行。
如果对方对仲裁结果不服或仍不履行裁决，您可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来证明您的诉求，并通过法律途径维护自身的合法权益。
四、注意事项
在处理此类纠纷时，您需要注意以下几点：
保留好所有相关证据和材料，不要遗失或损坏。
了解相关法律法规和政策，确保自己的诉求合法合理。
保持冷静和理性，避免采取过激行为导致问题升级。
如有需要，可以寻求专业律师或法律援助机构的帮助和支持。
综上所述，当遇到农村土地纠纷导致青苗被毁坏的情况时，您应及时固定证据、与对方沟通协商、申请仲裁或提起诉讼，并通过法律途径维护自身的合法权益。