机关单位应当将涉及绝密级或者较多机密级、秘密级国家秘密的机构确定为保密要害部门。以下是对此结论的详细解释：

一、保密要害部门的定义

保密要害部门是指机关、单位在日常工作中产生、传递、使用和管理绝密级或较多机密级、秘密级国家秘密的内设机构。这一概念的提出，旨在通过严格的保密管理，确保涉及国家秘密的机构能够安全、有效地运作，从而维护国家的安全与利益。

二、确定保密要害部门的依据

根据《中华人民共和国保守国家秘密法》及相关保密法规的规定，机关、单位应当对其内设机构进行保密审查，将那些涉及绝密级或者较多机密级、秘密级国家秘密的机构确定为保密要害部门。这一规定是强制性的，旨在确保国家秘密的安全。

三、保密要害部门的管理措施

1. 物理防护：保密要害部门需配备符合国家标准的防盗、防火、防潮等设施，安装监控报警装置，实行封闭式管理，以确保物理环境的安全。

2. 技术防控：采用身份鉴别、访问控制等技术手段，对进入人员及携带物品进行严格检查，防止未授权访问和信息泄露。同时，加强网络安全防护，确保信息系统的安全。

3. 人员管理：涉密人员须经过严格审查和培训，签订保密承诺书，明确其知悉范围和活动限制。建立完整的人员管理档案，对涉密人员进行动态管理。

4. 制度保障：制定详细的保密制度，明确保密责任、保密纪律和保密奖惩措施。定期开展保密检查，及时发现和纠正保密工作中的问题。

四、法律责任

对于违反保密规定，导致国家秘密泄露的，将依法追究相关责任人的法律责任。因此，机关、单位应当高度重视保密工作，确保保密要害部门的安全。

综上所述，机关单位应当将涉及绝密级或者较多机密级、秘密级国家秘密的机构确定为保密要害部门，并采取严格的保密管理措施，以确保国家秘密的安全。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。