在新版电子税务局进行印花税逾期补申报，您可以按照以下步骤操作：

一、确认逾期申报信息

首先，您需要进入电子税务局的“未申报查询”界面，系统会自动带出未申报记录，或者您也可以录入查询条件来查询未申报的印花税记录。在查询结果中，找到您需要补申报的印花税记录。

二、进入申报界面

找到需要补申报的印花税记录后，点击记录后面的“去申报”按钮，系统将会跳转到印花税申报界面。请注意，此时界面上应该会有“逾期申报”的字样。

三、填写申报表

在印花税申报界面，您需要填写相应的申报表。填写时，请仔细核对各项数据，确保准确无误。如果填写过程中有误，可以使用界面上的“重置当前报表”或“全部重置”按钮来清除已填写的数据，并重新填写。

四、提交申报

填写完申报表后，点击界面上的“申报”按钮进行提交。系统会对您的申报数据进行校验，如果校验通过，系统会提示申报成功，并显示相关的申报信息。

五、缴纳税款

逾期申报产生的税款需要通过电子税务局的“税费缴纳”功能进行缴纳。您可以依次点击“我要办税”-“税费申报及缴纳”-“税费缴纳”-“申报税费缴纳”，然后选择需要缴纳的税款进行支付。支付完成后，您可以通过“我要查询”-“缴款信息查询”来核实缴款结果。

另外，如果您在逾期申报过程中收到了《责令限期改正通知书》，您需要在规定的限期内完成改正，并根据通知书的指引进行后续操作。如果符合首违不罚规则，系统会自动推送处罚决定书及首违不罚承诺书；如果不符合首违不罚规则，您需要按照系统提示办理简易处罚事项。

总之，在进行印花税逾期补申报时，请务必仔细核对各项数据，确保准确无误，并按照规定的流程进行操作。如有任何疑问或困难，请及时联系税务局的客服人员或咨询专业人士。