要在新版电子税务局中变更法人的手机号，您可以按照以下步骤进行操作：

首先，您需要登录到电子税务局的系统界面。在成功登录后，请寻找并点击“登记信息变更”或类似的选项，这将带您进入变更操作界面。

接下来，在变更操作界面中，您需要选择需要变更的项目。在这个情况下，您应该选择“法定代表人（负责人）移动电话”这一选项，并明确表示您要修改这个信息，通常会有一个“是否修改”的选项供您选择，请确保选择“是”。

在确认要修改法人手机号后，系统可能会要求您通过手机获取验证码以进行身份验证。这是为了保障账户安全，防止未经授权的更改。请按照系统提示，输入您当前法人手机号接收到的验证码。

完成验证码验证后，您就可以输入新的法人手机号了。请务必仔细核对新输入的手机号，以确保其准确无误。

最后，在确认所有信息无误后，请点击“保存”或“提交”按钮，以完成法人手机号的变更操作。系统可能会提示您变更成功，或者需要您进行进一步的确认。

需要注意的是，具体的操作步骤可能会因不同地区或不同版本的电子税务局系统而有所差异。如果您在操作过程中遇到任何问题，建议查阅电子税务局的帮助文档或联系税务局的客服人员以获取更详细的指导。