当您与支付宝协商成功，确定一次性还清逾期款项时，您可以按照以下步骤进行还款：

一、确认还款金额与细节

首先，请确保您与支付宝客服明确确认了应还的总金额，这通常包括逾期本金、利息以及可能产生的滞纳金等费用。同时，确认还款的截止时间和具体的还款方式，以免出现误解或遗漏。

二、选择还款方式

支付宝提供了多种还款方式，您可以根据自己的实际情况选择最适合的方式：

1. 支付宝余额或余额宝还款：

   • 确保您的支付宝余额或余额宝中有足够的资金。
   • 通过支付宝APP的“我的”页面，找到相关借款入口（如花呗、借呗），进入后点击“还款”选项，按照页面提示完成还款操作。

2. 银行卡还款：

   • 绑定一张有效的银行卡到您的支付宝账户。
   • 在还款页面选择银行卡作为支付方式，按照页面提示输入支付密码等验证信息，完成还款。

3. 线下转账还款：

   • 如果支付宝提供了线下转账的还款方式（具体以支付宝官方信息为准），您可以按照支付宝客服提供的转账信息，通过银行柜台或网银进行转账。
   • 转账后，请务必保留转账凭证，并及时通知支付宝客服进行确认。

三、确认还款成功

完成还款操作后，请务必再次登录支付宝APP或官网，查看相关借款入口的账单情况，确认还款是否已成功处理，并且逾期状态是否已更新为已结清。

四、保留还款记录

为了避免后续可能出现的任何纠纷或误解，建议您截图或保存好还款成功的页面或凭证，以备不时之需。

五、注意事项

• 请确保在协商确定的还款截止时间前完成还款，以免产生额外的费用或影响您的信用记录。
• 如果在还款过程中遇到任何问题或疑问，请立即联系支付宝客服寻求帮助。

综上所述，一次性还清支付宝逾期款项需要您仔细确认还款金额与细节，选择合适的还款方式，并确保还款成功。同时，保留好还款记录以备后续需要。希望这些信息能对您有所帮助。