关于您咨询的“文物保护工程设计费预算定额”问题，这确实是一个专业且具体的问题，涉及到文物保护工程的预算编制和费用计算。首先，我想强调的是，文物保护工程的设计费预算定额通常会根据不同地区、不同类型的文物以及保护工程的复杂程度而有所差异。

您提到的《湖南文物建筑保护工程预算定额》(南方地区)是一个具体的地区性定额标准。对于这类定额标准，通常会详细列出各项工程内容的预算定额，包括但不限于人工费、材料费、机械费以及设计费等。然而，由于这是一个地区性的标准，它可能只适用于湖南地区或者更具体的南方地区，而不具有全国性的普遍适用性。

关于您提到的丝缝墙计算规则单位问题（平方米与立方米之间的矛盾），这实际上是一个具体的计算规则问题。在文物保护工程中，不同的工程内容可能会采用不同的计量单位，这取决于工程的性质和特点。对于您提到的矛盾，我建议直接参考《湖南文物建筑保护工程预算定额》(南方地区)中的相关规定，或者联系当地文物局或相关机构进行咨询，以获取最准确的解答。

至于文物保护工程设计费的预算定额，这通常需要根据具体的工程内容、设计要求以及市场情况等因素来确定。一般来说，设计费的预算定额会包括设计人员的工资、福利、办公费用以及可能产生的差旅费等其他相关费用。在实际操作中，可以根据工程的复杂程度、设计人员的资历和经验以及市场行情等因素进行适当调整。

总的来说，文物保护工程设计费预算定额是一个复杂而具体的问题，需要根据实际情况进行具体分析。我建议您在编制预算时，充分考虑到工程的实际情况和市场行情，并参考相关的定额标准和规定，以确保预算的准确性和合理性。同时，也可以咨询专业的文物保护工程机构或专家，以获取更专业的建议和指导。