您好，撤回离婚申请后，相关材料是会被存档的。

根据《民法典》及民政部的相关规定，在离婚冷静期内，如果任何一方不愿意离婚，可以向受理离婚登记申请的婚姻登记机关撤回离婚登记申请，并亲自填写《撤回离婚登记申请书》。婚姻登记机关在核实无误后，会发给《撤回离婚登记申请确认单》，并将《离婚登记申请书》、《撤回离婚登记申请书》与《撤回离婚登记申请确认单（存根联）》一并存档。

因此，如果您在冷静期内撤回了离婚申请，那么这一行为以及相关的申请材料都会被婚姻登记机关存档保留。这是为了确保婚姻登记的准确性和完整性，也是为了更好地管理和维护婚姻登记档案。

希望这个解答能够帮到您，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。