房贷还清后，在个税APP上的正确处理方式是进行信息的更新，停止该房贷的利息抵扣个税，也就是说，您需要对已还清的房贷信息进行作废处理。以下是详细的解释和操作流程：

政策依据：

根据《个人所得税专项附加扣除暂行办法》，当您或您的配偶使用商业银行或住房公积金个人住房贷款购买中国境内住房，并发生首套住房贷款利息支出时，可以在实际发生贷款利息的年度内享受每月1000元的定额扣除，扣除期限最长为240个月。但一旦房贷完全还清，由于不再产生贷款利息，您就不再符合享受这项专项附加扣除的条件。

操作流程：

1. 登录个税APP：首先，您需要打开“个人所得税APP”，点击右下角的【个人中心】，然后选择【登录/注册】并输入账号密码进行登录。

2. 进入专项附加扣除填报页面：登录成功后，在APP首页找到并点击【专项附加扣除填报】选项。

3. 选择扣除年度与项目：在专项附加扣除填报页面中，选择对应的扣除年度（请确保选择的是已经还清房贷的年度），然后点击【住房贷款利息】选项。

4. 作废已还清的房贷信息：在住房贷款利息页面中，您会看到已填报的房贷信息。对于已还清的房贷，直接选择【作废】选项，并按照系统提示进行确认操作即可。

注意事项：

• 请确保您只享受一次首套住房贷款的利息扣除。若之前已享受过该政策且房贷已还清，则在后续的纳税年度中不能再享受此扣除。
• 房贷还清后，请务必及时在个税APP上进行作废处理。若未及时处理而继续申报扣除，将构成虚假申报，可能影响您的纳税信用记录，并可能面临税务行政处罚。
• 建议您定期关注税务部门的相关通知和规定，以确保准确履行纳税义务并享受相关权益。

综上所述，房贷还清后，请及时在个税APP上对相关信息进行作废处理，以确保您的个税申报准确无误。