针对“三类医疗器械证过期怎么处罚”的问题，首先需要明确的是，三类医疗器械证的过期属于未依法办理延续仍继续从事相关活动的违法行为。对于此类违法行为，具体的处罚措施和程序会依据相关的法律法规以及地方政策进行。

根据公开信息，对于医疗器械生产许可证等证件有效期届满后未依法办理延续的违法行为，市场监督管理部门会依法进行查处。处罚的程序和时限通常遵循《市场监督管理行政处罚程序暂行规定》。一般来说，适用一般程序办理的案件应当自立案之日起九十日内作出处理决定。但因案情复杂或其他原因，这个时限可能会有所延长，具体需经市场监督管理部门负责人批准，并可能进一步由负责人集体讨论决定是否继续延期。

在具体的处罚措施上，虽然具体的罚款数额、警告、停产停业等处罚方式可能会因地区、案情严重程度等因素有所不同，但可以确定的是，过期未续证的行为将会受到法律的制裁。因此，建议相关企业和个人务必注意证件的有效期，并在有效期届满前及时办理延续手续，以避免不必要的法律风险。

总的来说，三类医疗器械证过期后的处罚是一个涉及多个因素和程序的问题。为了准确了解具体的处罚措施和程序，建议咨询当地的市场监督管理部门或专业律师，以获取最准确、最权威的信息。