当发现身份证被他人盗用办理了营业执照时，这是一个严重的法律问题，需要立即采取行动。以下是我为你提供的详细建议，以确保你的权益得到有效保护：
首先，明确结论与首要行动：
- 确认营业执照的真实性，若确为真实，需迅速通过法律途径维护自身权益。
接下来，你可以采取以下具体步骤：
收集关键证据：
- 身份证丢失记录：若曾丢失过身份证且报过警，提供报警记录作为证明。
- 不在场证明：收集能证明在营业执照登记时间你并不在办理地或未从事相关经营活动的证据。
- 其他相关证据：如通信记录、邮件等，任何能证明身份被冒用的材料。
向市场监督管理部门反映：
- 携带有效身份证件和收集到的证据，前往营业执照登记注册所在地的市场监督管理部门。
- 详细说明情况，并提交证据，填写相关投诉举报表格，配合调查。
报警处理：
- 身份证被冒用涉及违法犯罪行为，应向当地公安机关报案，并提供详细情况和证据。
- 公安机关将进行调查，并依法追究相关人员的法律责任。
要求撤销登记：
- 在市场监督管理部门调查核实后，要求其撤销该营业执照登记。
- 关注个人信用记录，如发现因该冒用行为导致的不良记录，及时向相关金融机构和征信管理部门说明情况，申请更正。
追究责任与赔偿：
- 若因身份证被冒用造成经济损失或其他损害，可通过民事诉讼方式要求冒用者和相关责任方承担赔偿责任。
- 准备好充分的证据，证明损失与冒用行为之间的因果关系。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》第四十条，提交虚假材料或者采取其他欺诈手段隐瞒重要事实取得市场主体登记的，受虚假市场主体登记影响的自然人可以向登记机关提出撤销市场主体登记的申请。登记机关受理申请后，应当及时开展调查，经调查认定存在虚假市场主体登记情形的，登记机关应当撤销市场主体登记。
总结：
发现身份证被冒用办理营业执照时，应迅速采取行动，包括收集证据、向市场监督管理部门反映、报警处理、要求撤销登记以及追究责任与赔偿。通过这些步骤，你可以有效地保护自己的合法权益，避免进一步的法律风险和经济损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。