门市房产证的分割办理手续，首先需要明确的是，这通常涉及到不动产的分割，必须依据相关部门的批准文件来进行。以下是具体的步骤和注意事项：

一、明确分割需求与条件

1. 确定分割方案：首先，您需要明确房产的分割方案，包括分割后的各部分面积、位置等。
2. 了解相关政策：根据当地的不动产登记政策，了解分割房产的具体要求和限制。

二、准备相关材料

1. 设计图纸：需要由正规设计院出具的分割设计图纸，该图纸应明确分割后的房产布局。
2. 测绘报告：由专业测绘机构出具的房产测绘报告，明确分割后的各部分面积。
3. 安全鉴定：如果分割涉及到房屋结构的改变，可能需要进行房屋安全鉴定。
4. 消防验收（如需）：根据当地政策，如果分割后的房产需要单独进行消防验收，应提前准备好相关材料。
5. 其他材料：包括房产证、身份证、分割协议等。

三、提交申请与审批

1. 提交材料：将准备好的材料提交给当地的不动产登记机构或相关部门。
2. 部门审批：根据当地政策，可能需要经过自然资源、住建、消防等多个部门的审批。特别是涉及到土地使用权分割的，应确保符合土地出让合同中的约定，并可能需要自然资源部门的批准。
3. 缴纳费用：根据当地政策，可能需要缴纳一定的登记费、测绘费等。

四、办理分割登记

1. 实地查看：在某些情况下，不动产登记机构可能会进行实地查看，以确保分割后的房产符合规划要求。
2. 分割办证：经过审批后，您可以前往不动产登记机构办理分割后的房产证。

五、注意事项

1. 遵守政策：在整个过程中，应严格遵守当地的不动产登记政策和相关法律法规。
2. 沟通协调：如果涉及到多个部门的审批，应提前与相关部门进行沟通协调，确保流程的顺利进行。
3. 备注与承诺：在办理分割登记时，可能需要在房产证上添加备注，说明分割后的房产在转让时需要满足的条件（如实体墙分割到位、消防验收合格等）。同时，申请人应承诺遵守这些条件。

综上所述，门市房产证的分割办理手续需要遵循一定的流程和规定。在办理前，建议详细了解当地政策和要求，并准备好相关材料。如有需要，可以寻求专业律师或房产中介的帮助。