要害部门应当遵循以下两个基本原则：
分级确定原则：
- 中央和国家机关及直属单位的保密要害部门部位，由各机关单位确定，并报国家保密行政管理部门确认。
- 省级机关及直属单位的保密要害部门部位，由各机关单位确定，报所在省（区、市）保密行政管理部门确认，并报国家保密行政管理部门备案。
- 中央和国家机关下属单位和省级以下机关单位的保密要害部门部位，应报中央和国家机关保密工作机构或省（区、市）保密行政管理部门审核确认。
最小化原则：
- 保密要害部门应当是机关、单位内部涉及重要国家秘密事项的最小行政单位，或其绝大多数内设部门涉及重要国家秘密事项的行政单位。
- 保密要害部位应当是存放、保管涉密载体的最小专用、独立、固定场所。
这两个原则确保了保密要害部门部位的确定既符合法定要求，又能够精确到最小单位，从而有效加强保密管理，防止国家秘密的泄露。如果您在实际操作中遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会为您提供专业的帮助。