门诊起付线确实是按医院分别计算的。起付线，也称扣除保险，是医疗保险开始支付医疗费用的最低标准，低于起付线的医疗费用由被保险人自负，超出起付线以上的医疗费用则由医疗保险按相关规定支付。

根据不同地区的医保政策和医疗机构级别，门诊起付线的标准也会有所不同。例如，在某些地区，一级、二级和三级医疗机构的门诊起付线可能会有所差异。通常，较高级别的医疗机构（如三级医院）的起付线会相对较高，而较低级别的医疗机构（如一级医院或社区卫生机构）的起付线则会相对较低，甚至可能不设起付线。

此外，医保政策还可能对特殊人群（如老年人、学生儿童等）或特定情况（如第二次及以后住院等）的起付线进行特殊规定，如减半或免除起付线等。

因此，在具体计算门诊起付线时，需要根据当地的医保政策和就诊的医疗机构级别来确定。如果您对当地的医保政策或门诊起付线标准有疑问，建议咨询当地的医保部门或相关医疗机构以获取准确的信息。